L’histoire de la crypte du Martyrium remonterait à la seconde moitié du IIIe siècle, lorsque Saint Denis, évêque de Paris, est martyrisé puis inhumé sur la colline de Montmartre. Deux siècles plus tard, Sainte Geneviève y fait bâtir une chapelle pour abriter le fameux tombeau. Dès lors, la crypte du Martyrium devient un important lieu de pèlerinage chrétien. En 1534, Ignace de Loyola et ses compagnons viennent d'ailleurs y prononcer leur "Vœu de Montmartre", qui donne naissance à l'ordre des Jésuites. Endommagée au fil des siècles, la crypte du Martyrium est reconstruite au IXe siècle, puis de nouveau à la fin du XIXe siècle.
