Baltzenheim è stato occupato fin dall'antichità, ma il villaggio viene menzionato per la prima volta nell'847 con il nome di Baldolfesheim. Baltzenheim fu distrutta durante la Guerra dei Trent'anni e rasa al suolo durante l'assedio di Vieux-Brisach. Nel XVIII secolo il Reno straripò più volte e nel XIX secolo furono intrapresi lavori di arginatura. Un tempo Baltzenheim era dedita alla pesca e all'agricoltura, ma da allora si è convertita all'industria.
Monumenti : Chiesa di St. Michel, campanile e torre a capanna (XII secolo, MH francese), rilievi romanici, case a graticcio (1660), panchina dell'Impératrice Eugénie, "Blockhaus H8"